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PCR技術的特點

2010-10-28 [2876]

(二)特異性強
自從提取出耐熱TaqDNA聚合酶以來,在熱變性處理時不被消化、不必在每次循環擴增中再加入新酶,以及在較高溫度下連續反應,顯著提高了PCR反應產物的特異性。PCR擴增的特異性還依賴于兩個引物設計的好壞,依賴于引物與模板結合的正確性。PCR反應時退火溫度對特異性也有影響,一般來說,退火溫度越高,擴增的特異性越好。高溫啟動法也可增加PCR擴增的特異性,即通過在高溫(70℃)下加入某些必需因子(DNA聚合酶、模板DNA、Mg2+或引物等),使TaqDNA聚合酶僅在反應達到較高溫度(>70℃)時才發揮作用。其他因素如酶濃度、dNTP、Mg2+、pH值等對PCR的特異性也有一定的影響。

一)敏感性高
如前所述,PCR產物的生成以指數方式增加,能將極微量的靶DNA成百萬倍以上地擴增到足夠檢測分析量的DNA。這是PCR技術zui主要的特點,它可對單拷貝基因、單個細胞、單根頭發、一滴血等微量標本進行分析。

(三)操作簡便、快速
目前國內外已有多種類型的PCR擴增儀,只需把反應材料按一定濃度混合,置于儀器內,反應便按所輸入的程序進行。整個PCR操作過程,從標本處理、PCR擴增到產物分析,可在4h內完成全部實驗。擴增產物可直接供作序列分析和分子克隆,擺脫繁瑣的基因分析方法;可直接從總RNA或DNA中或部分DNA已降解的樣品中分離目的基因,省去須先進行克隆后再作序列分析的模式。已固定和包埋的組織或切片亦可用于檢測。

(四)可擴增RNA或cDNA
先按通常方法用寡脫氧核苷酸引物和反轉錄酶將mRNA轉錄成主鏈cDNA,再將得到的單鏈cDNA進行PCR擴增。即使mRNA轉錄片段只有cDNA中的0.01%,也能經PCR擴增出10倍242bp對長度的特異性片段。有些外顯子分散在一段很長的DNA中,難于將整段DNA大分子擴增和做序列分析。若以mRNA作為模板,則可將外顯子集中,用PCRl次便完成對外顯子的擴增并進行序列分析。

(五)有一定程度單核苷酸錯誤摻入
TaqDNA聚合酶缺少3’-5’核酸外切酶活性,因而不能糾正反應中發生的核苷酸錯誤摻人;與大腸桿菌聚合酶I Klenow片段相比較,用TaqDNA聚合酶的反應錯誤摻人相對多些。但在PCR擴增過程中,其錯配率一般只有約1/萬,足可以供特異性分析。
 

(六)對起始材料質量要求低
PCR技術對擴增樣品的要求不高,僅含極微量目的DNA(pg、ng)、DNA粗制樣品或者總RNA,都可用做起始材料來獲得較多的目的產物。擴增樣品既可以是純化的,也可以是粗制的;既可以是新鮮組織,也可以是陳舊樣品;既可以是細胞,也可以是體液;既可以是完整的大分子,也可以是部分降解的DNA。

 

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